Nuestra Señora de los Ángeles, uno de los mejores ejemplos de arquitectura gótica de Cantabria, se alza en la parte alta del casco antiguo de San Vicente de la Barquera. Fue mandada construir por Alfonso VIII, a raíz de la concesión del fuero en 1210, que supuso el comienzo de una época de esplendor en la villa. Se trata de un templo con planta de tres naves cubiertas por bóvedas de crucería que terminan en ábsides poligonales. Las naves fueron iniciadas en el siglo XIII y en el siglo XV se añadieron varias capillas laterales; en aquellos siglos se terminaron las portadas de las fachadas occidental y meridional ornadas con relieves alegóricos. En 1530 el templo se amplió por la cabecera, construyéndose el crucero, la capilla mayor y la sacristía; en las mismas fechas se construyó la capilla de los Corro y la portada de la sacristía. A finales del siglo XIX se le añadió el cuerpo neogótico de campanas.

La iglesia atesora un patrimonio escultórico de primer orden del que destacan las piezas de la capilla de los Corro, que custodia el sepulcro de alabastro de dos miembros de la familia realizado hacia 1400 y la figura de mármol del Inquisidor Antonio del Corro, una de las mejores piezas de la escultura funeraria española renacentista, diseñada por el arquitecto andaluz Hernán Ruiz ‘el Joven’ y ejecutada por el escultor castellano Juan Bautista Vázquez ‘el Viejo’, discípulo de Berruguete, entre 1553 y 1562. El retablo mayor fue realizado hacia 1675-1680 por el maestro ensamblador Pedro de la Puente Tolnado (se plantea la intervención de Juan de Tolnado Herrera, autor de otros retablos que tienen un importante número de similitudes con éste) y dorado hacia 1693 por Simón de Haro; responde al estilo prechurrigueresco e incluye algunos elementos novedosos (columnas salomónicas y cierre en semicírculo del ático); está presidido por Nuestra Señora de los Ángeles, talla gótica de finales del siglo XV. Por último señalar que la capilla de la familia Mata, custodia un retablo del XVIII que alberga la imagen del Santo Cristo de los Afligidos. La iglesia de Nuestra Señora de los Ángeles fue declarada Monumento de Interés Histórico en 1931.

El convento de San Luis está también en la villa de San Vicente de la Barquera, junto al extremo occidental del puente de la Maza. Construido en el siglo XV, después de la invasión francesa y los procesos de desamortización del siglo XIX, fue abandonado y la fábrica se arruinó. En la actualidad se conserva una gran parte de los muros, ábsides, arcos góticos y fragmentos de las bóvedas rodeados por una cuidada vegetación. La iglesia presentaba una sola nave con capillas hornacinas, cabecera poligonal, transepto y coro a los pies. Se empleó mampostería en los muros, en los que se conservan restos de policromía, y sillería para el despiece de vanos y pilares. El claustro, cocina y refectorio responden al estilo barroco. Su origen se remonta a la llegada de los franciscanos a la villa en 1454. La construcción del convento se inició bajo el patrocinio de la casa Guevara una década más tarde, hacia 1468, cuando la comunidad se instaló en este lugar situado junto a la ría. En 1517, cuando Carlos I llegó a España con 17 años para ser coronado rey, se hospedó en este lugar, a la espera de recuperarse de una enfermedad. Durante toda la Edad Moderna, la mayoría de las familias nobles de la villa hicieron donaciones a la comunidad: Guevara, Calderón de la Barca, Oreña, Castillo... a construir sus capillas funerarias en el interior del templo. Fue declarado Bien de Interés Cultural en 1992.

La capilla de la Virgen de la Barquera se encuentra junto a la entrada del puerto. Aunque se ha documentado la existencia de un edificio medieval en el XV, la actual fábrica fue erigida entre los años finales del siglo XVII y el primer tercio del XVIII fue levantado con el propósito de albergar a los devotos de la Virgen de la Barquera durante las festividades populares. La capilla consta de un volumen rectangular con muros armados con piedra de mampostería y sillería en los esquinales, contrafuertes y cercos de los vanos. Se trata de una única nave central de tres tramos formados por arcos tajones de medio punto que se apoyan sobre pilastras y soportan bóvedas de terceletes en sus dos primeros tramos y bóveda rebajada en la cabecera, dividida en segmentos por gallones. En la cabecera de la nave, a ambos lados del retablo de estilo neoclásico (1820), se abren unas puertas que dan acceso a la sacristía, y que presenta una tipología constructiva semejante a la de la nave principal, aunque con unas dimensiones sensiblemente reducidas. El edificio se atribuye a Toribio Sánchez de Lamadrid. Según la leyenda la Virgen de la Barquera llegó a este lugar en una embarcación sin tripulación, ni velas, ni remeros. En su honor se celebra la fiesta de la Folía, de interés turístico nacional, con la procesión marítima de la imagen.El santuario fue incluido en el Inventario General del Patrimonio Cultural de Cantabria en 2001.

La iglesia parroquial de Gandarilla es un edificios del siglo XVII, con nave en bóveda de cañón y cúpula en el crucero. El retablo mayor es un buen ejemplo del barroco popular del XVIII. La iglesia de Nuestra Señora de los Tomases fue edificada entre 1897 y 1899 sobre un proyecto de Manuel Casuso, que sustituyó a un antiguo santuario localizado entre la Acebosa y Abaño. Finalmente, en la localidad de Abaño pueden verse las ruinas de la capilla de un antiguo lazareto: el de San Lázaro , inventariado en 2003, del siglo XIII, en las cuales pueden distinguirse varias pinturas murales de embarcaciones de gran interés.