Ganadería y agricultura. Las actividades agropecuarias en este municipio sólo quedan como restos residuales en los pequeños pueblos, ya que ha pasado a vivir básicamente del turismo. La explotación ganadera más importante es la del vacuno, teniendo las otras una incidencia prácticamente inexistente.

Pesca. La villa cuenta con un pequeño puerto pesquero, que antiguamente exportaba blenda y calamina y del que, asimismo, se importaba carbón y cemento. En la zona de servicio del puerto hay una lonja para la subasta del pescado. Sin embargo, la pesca desembarcada se subasta en las cofradías de Santander y San Vicente de la Barquera. Las capturas más frecuentes eran el besugo y el congrio en época invernal, y la sardina y el bonito durante el verano. Hay que señalar que en el siglo XVII era muy importante la caza de la ballena, que se aproximaba a la costa. Actualmente, gran parte de la pesca que se realiza en Comillas son crustáceos que se capturan muy cerca del puerto.